کتابهای تالیف شده
  1. خدایاری فرد، محمد و مک کلنون، جیمز (1400). ما سیزده نفر بودیم. انتشارات کمبریج.
  2. خدایاری فرد، محمد؛ آذربایجانی، مسعود و شهابی، روح‌الله (1400). درآمدی بر مبانی روانشناسی اسلامی. تهران: انتشارات دانشگاه تهران. 
  3. خدایاری فرد، محمد؛ آذربایجانی، مسعود؛ شهابی، روح اله و زندی، سعید(1400). مقدمه ای بر روانشناسی اسلامی. لیدن: بریل
  4. خدایاری­ فرد، محمد؛ آسایش، محمدحسن و پرند، اکرم (1400). استرس: نظریه‌ها، سبک‏هاي‌ مقابله ‏ای و مقیاس‏های ارزیابی‌. تهران: انتشارات دانشگاه تهران.
  5. خدایاری­فرد، محمد (1399). آسیب ­شناسی روانی كودك و نوجوان: تجدیدنظر کلی بر اساس DSM-5؛ چاپ ششم. تهران: انتشارات دانشگاه تهران.
  6. خدایاری­فرد، محمد؛ حسنی راد، مرجان و عابدینی، یاسمین (1399). روان‌شناسی شخصیت. تهران: انتشارات دانشگاه تهران.
  7. نوربخش، یونس؛ خدایاری‌فرد، محمد؛ افروز، غلامعلی؛ حجازی، الهه؛ شکوهی یکتا، محسن؛ رستمی، رضا؛ حاتمی، جواد و آسایش محمدحسن (1399). ویروس کرونا، تاب‌آوری و سلامت روان: راهبردهای روان‌شناختی برای مقابله با اضطراب، استرس و مدیریت سوگ. تهران: انجمن اولیا و مربیان.
  8. خدایاری­ فرد، محمد (1395). مسائل‌ نوجوانان‌ و جوانان‌. چاپ دوازدهم. تهران: انتشارات‌ انجمن‌ اولياء و مربيان.
  9. خدایاری­ فرد، محمد و عابدینی، یاسمین (1394). نظريه­ ها و اصول خانواده­ درماني و كاربرد آن در درمان اختلالات كودكان و نوجوانان. چاپ دوم. تهران: انتشارات دانشگاه تهران.
  10. خدایاری­ فرد، محمد و پرند، اکرم (1394). ارزيابي و آزمونگري روان­شناختي. چاپ سوم. تهران: انتشارات دانشگاه تهران.
  11. خدایاری­ فرد، محمد و عابدینی، یاسمین (1393). مشکلات سلامتي نوجوانان و جوانان. چاپ سوم. تهران: انتشارات دانشگاه تهران.
  12. خدایاری­ فرد، محمد؛ فقیهی، علی­نقی؛ غباری بناب، باقر؛ شکوهی یکتا، محسن و رحیمی­نژاد، عباس (1391). مباني نظري و روش­ شناسي مقياس­هاي دينداري. تهران: انتشارات آوای نور.
  13. خدایاری­ فرد، محمد و سهرابی، فرامرز (1390). روانشناسي باليني کودک و نوجوان. تهران: انتشارات آوای نور.
  14. خدایاری­ فرد، محمد و پرند، اکرم (1390). استرس‌ و روش‌هاي‌ مقابله‌ با آن‌. تهران: انتشارات دانشگاه تهران.
  15. خدایاری­ فرد، محمد (1387). مشاوره: مباني روان­شناختي. چاپ دوم. تهران: انتشارات یسطرون.
  16. خدایاری­ فرد، محمد (1385). روانشناسي مرضي كودك و نوجوان. تهران: انتشارات دانشگاه تهران.
  17. خدایاری­ فرد، محمد و شکوهی یکتا، محسن (1385). تشخيص و درمان اختلالات روان­شناختي كودك و نوجوان. تهران: انتشارات یسطرون.
  18. خدایاری­ فرد، محمد (1381). مسائل دوران كودكي و نوجواني. تهران: انتشارات یسطرون.
  19. مبارزه با افسردگی (جزوه آموزشی)
کتابهای ترجمه شده
  1. نیمک، رایِن و مک‌گرث، رابرت ای. (1402). بر قلۀ اقتدار با توانمندی‌های منش. ترجمۀ محمد خدایاری‌فرد و مرجان حسنی راد. تهران: انتشارات سایۀ سخن.
  2. نیمک، رایان ام. (1399). مداخلات در توانمندی‌های منش: راهنمای عملی بالینگران. ترجمه محمد خدایاری‌فرد، مرجان حسنی راد و کتایون حلمی. تهران: انتشارات دانشگاه تهران.
  3. فلکسمن، پائول؛ بلک لدج، جی تی و باند، فرانک (1395). درمان مبتنی بر پذیرش و تعهد: ویژگی­های متمایزکننده از درمان شناختی رفتاری، ترجمه محمد خدایاری­ فرد و ناهید حسینی­ نژاد. تهران: انتشارات دانشگاه تهران.
  4. بایلینگ، پیتر جی؛ مک کب، رندی ای و آنتونی، مارتین ام (1394). گروه‌درمانگري شناختی-رفتاري، ترجمۀ محمد خدایاری­ فرد و یاسمین عابدینی. تهران: انتشارات دانشگاه تهران.
  5. زارب، ژانت (1393). ارزيابي‌ و شناخت‌ـرفتاردرماني‌ نوجوانان، ترجمۀ محمد خدایاری­ف رد و یاسمین عابدینی. تهران: انتشارات رشد.
  6. کایون، برونو ای (1393). شناخت رفتار درمانگري يکپارچه‌شده با ذهن­ آگاهي: اصول و روش اجرا، ترجمۀ محمد خدایاری­ فرد، کوروش محمدی حاصل و مریم دیده­دار. تهران: انتشارات دانشگاه تهران.
  7. بارکر، فیلیپ (1391). مصاحبه‌هاي‌ باليني‌ با كودكان‌ و نوجوانان‌، چاپ سوم. ترجمۀ محمد خدایاری فرد و کامران علوی. تهران: انتشارات دانشگاه تهران.
  8. کیو، سوزان (1386). طبقه‏ بندي و تشخيص اختلالات روان­شناختي، ترجمۀ محمد خدایاری فرد و غلامرضا جعفری کندوان. تهران: انتشارات دانشگاه تهران.
  9. اسکات، مایکل؛ استرادلینگ، استفان و درایدن، ویندی (1386). مشاوره شناختی-رفتاري، ترجمۀ محمد خدایاری فرد. تهران: انتشارات دانشگاه تهران.
  10. گیلبرت، سارا (1386). روان‌­درماني‌ چيست‌؟ ويژه‌ دوره‌ نوجواني‌ و جواني، چاپ چهارم؛ترجمۀ محمد خدایاری فرد و حسین لطافت. تهران: انتشارات‌ انجمن‌ اولياء و مربيان.
فصل های چاپ شده در کتب تدوینی
  1. خدایاری‌فرد، محمد؛ پورحسین، رضا؛ پاکدامن، شهلا و زندی، سعید (2023). نقاشی خدا در کودکان ایرانی: ملاحظات جمعیت‌شناختی و زمینه‌ای. در پ. ی. برانت، ژ. دندرووا-رابرت، ک. کوکو، د. وینک و ف. داربلای (سرویراستاران)، وقتی کودکان خدا را ترسیم می‌کنند: رویکردی چندفرهنگی و میان‌رشته‌ای به بازنمایی کودکان از عوامل ماوراء‌طبیعی (صص 325-361). شم: اسپرینگر.